مطالعه تنوع ژنتیکی جدایه های pseudomonas syringae pv. syringae برنج و گندم در استان گیلان با استفاده از نشانگرهای rapd

تنوع ژنتیکی 60 جدایه از باکتری pseudomonas syringae pv. syringae، عامل پوسیدگی باکتریایی غلاف برگ برنج و بلایت باکتریایی برگ گندم، جمع آوری شده از خزانه و مزارع برنج و گندم استان گیلان، با استفاده از نشانگر rapd مورد ارزیابی قرار گرفت. تمامی 60 جدایه طی سال های 1384-1386 در استان گیلان شناسایی شده بودند. جدایه xanthomonas arboricola pv. pruni 2535 cfbp جداشده از آلو از کشور فرانسه به عنوان گروه خارجی مد نظر قرار داده شد. ده آغازگر به کار گرفته شده در مجموع 243 نوار چندشکل ایجاد کردند. بیشترین میزان اطلاعات چندشکل مربوط به آغازگر 9/70 (3529/0) و کمترین مقدار آن مربوط به آغازگر g13 (1565/0) بود. تجزیه واریانس مولکولی داده های rapd نشان داد که تفاوت ژنتیکی بین جمعیتی بیشتر از تفاوت درون جمعیت ها است. تجزیه خوشه ای جدایه ها بر اساس ضریب تشابه تطابق ساده و روش upgma در سطح تشابه 73% جدایه ها را در 4 گروه مجزا قرار داد. گروه اول شامل 9 جدایه مزرعه برنج، گروه دوم شامل 31 جدایه بود که در سطح تشابه 78% از دو زیر کلاستر شامل 2 جدایه از مزرعه برنج به همراه 9 جدایه از گندم و زیر کلاستر دوم در سطح تشابه 83% از دو زیر کلاستر شامل 13جدایه از گندم و 7 جدایه خوشه برنج تشکیل شد. گروه سوم شامل 20 جدایه بود، که در سطح تشابه 83% از دو زیر کلاستر شامل10 جدایه خزانه برنج به همراه 2 جدایه خوشه برنج و 6 جدایه خوشه برنج به همراه 2 جدایه خزانه برنج تشکیل یافت. گروه چهارم نیز شامل جدایه گروه خارجی بود. نتایج حاصل از این بررسی نشان داد که تنوع ژنتیکی بالایی بین جدایه های p. s. pv. syringae جداشده از برنج در مراحل مختلف رشد وجود دارد که با تجزیه داده های rapd قابل شناسایی است. همچنین آغازگرهای rapd به کار رفته قادر به تفکیک جدایه ها بر اساس میزبان نبودند.